| Scoliciosporum | Monodictys cellulosa |
| Scytinium | Didymellopsis pulposi |
| Sphaerophorus | Opegrapha sphaerophoricola |
| Sphaerellothecium minutum | |
| Sphaerotheca | Ampelomyces quisqualis |
| Squamarina | Squamarina cartilaginea |
| Stereocaulon | Lasiosphaeriopsis stereocaulicola |
| Paranectria alstrupii | |
| Roselliniella stereocaulorum | |
| Sphaerellothecium stereocaulorum | |
| Stereum | Sphaerostilbella penicillioides |
| Stictis sp. P3971 | |
| Sticta | Abrothallus welwitschii |
| Corticiruptor abeloneae | |
| Hemigrapha atlantica | |
| Stilbospora | Cosmospora stilbosporae |
| Strangospora | Intralichen lichenum |