| Degelia | Degelia atlantica - see Pectenia atlantica |
| Degelia cyanoloma - see Pectenia cyanoloma | |
| Degelia ligulata - see Pectenia ligulata | |
| Degelia plumbea - see Pectenia plumbea | |
| Dendrographa | Dendrographa decolorans |
| Dermatocarpon | Dermatocarpon intestiniforme |
| Dermatocarpon leptophyllodes | |
| Dermatocarpon luridum | |
| Dermatocarpon miniatum | |
| Diarthonis | Diarthonis spadicea |
| Dibaeis | Dibaeis baeomyces |
| Dichoporis | Dichoporis taylorii |
| Dimerella | Dimerella lutea - see Coenogonium luteum |
| Dimerella pineti - see Coenogonium pineti | |
| Dimerella tavaresiana - see Coenogonium tavaresianum | |
| Diploicia | Diploicia canescens |
| Diploschistes | Diploschistes caesioplumbeus |
| Diploschistes muscorum | |
| Diploschistes scruposus | |
| Diplotomma | Diplotomma alboatrum |
| Diplotomma chlorophaeum | |
| Diplotomma parasiticum | |
| Dirina | Dirina fallax |
| Dirina massiliensis |